明清之争本是司空见惯，但是突然发现“十二平均律”也被作为明优清劣的证据：
明朝有着辉煌地音乐艺术成就，十二平均律就在明朝被提出，这是现在音乐地奠基石,但在它却不能生存在它出现地母国大地上，因为它被满清禁毁了。
这个实在让人大跌眼镜了，颠倒黑白啊。
朱载堉明神宗年间就把他的新法密律呈现给皇帝，虽然他的《进律书奏疏》写得小心翼翼，但是他的这套理论还是被打入冷宫，无人问津，为什么？ 因为他的算法挑战了被奉为神圣的“三分损益法”，所以即便是在明朝，也根本没有人理会他的“十二平均律”，这就像一切科技创新都会被旧思想所禁锢一样，特别是在涉及到礼乐这种大事的时候，皇帝大臣们自然异常的保守。
而清代更没有禁毁“十二平均律”（一种算法如何禁毁？），事实上清代的律书还直接吸取了朱载堉的成果。但是，和明朝一样，清朝继续推崇神圣的三分损益法，所以批判过“十二平均律”的离经叛道，譬如在《律吕正义后编》中对朱的十大批判，还有在 《四库全书总目提要》对朱载堉《乐律全书》的介绍（如果要禁毁“十二平均律”，也不会把朱的书收入四库了），但是骂“十二平均律”的那些人自然也知道“十二平均律”的精妙，就像他们在《律吕正义后编》里承认的那样：“ 顾其所定十二律之率，皆以倍应钟之率累除而得之，正律恰为倍律之半，终而复始，可不谓精于算乎？” 但是他们不能接受的是对“三分损益法”的否定，就好比“地心说”的鼓吹者质问“日心说”的支持者“你们把上帝放在什么位置？”一样。
但是骂归骂，用还是要用。《四库全书总目提要》里明确的说了： ”圣祖仁皇帝《律吕正义》一书备采其说（指朱载堉的十二平均律）”。后人杨荫浏也说过清代的律书“ 实系剽窃朱氏之唾余而成。” 也就是说清代虽然在道德上骂朱载堉，但是在实际上非但没有禁毁十二平均律，反而还采用了这一理论。骂是在道德层面的，用是在科学层面的。就像历史反复证明的一样，道德和科学往往不容，但是这并不能阻止坚信上帝造人的神汉们使用最新的生物技术。
而朱载堉因为担心自己的理论被认为是离经叛道，所以也努力的想在自己的理论中融入一些传统的成分，譬如假借黄帝之名，又譬如因为他用到了sqrt(2) 就硬要扯上周公（通过〈周髀算经〉）。但是这样的生拉硬套，反而被道德人士揪住小辫子，猛烈批判。
“十二平均律”不过是重复了诸多科技创新的轨迹而已，实在看不出它如何体现了明代比清代的高明，明代跟本就不关心它，而清代虽然批判它，但是却使用了它；如果硬要比较，也许可以说明代更真诚，清代更虚伪吧，诚实但是拒绝科学进步与虚伪但是接受科学进步，孰优孰劣呢？恐怕又是一个道德判断与科学判断的矛盾吧。